新技術可快速測出兒童白血病的基因組異常

新華社東京9月22日電(記者錢錚)日本東京大學和國立癌症研究中心日前聯合發佈新聞公報說,兩家機構的研究人員利用一種新的基因組分析法,快速且全面地檢測出兒童白血病的基因組異常。

基因組分析對於癌症的精準診斷、確定治療靶點非常重要。日本研究人員利用納米孔測序儀的自適應採樣技術進行測序,然後處理和分析所獲數據。納米孔測序儀能進行長讀長測序,即讀取更長的脫氧核糖核酸(DNA)片段,與常規測序技術相比,在解析複雜的基因組結構方面具有獨特的優勢。自適應採樣則是一種實時動態調整採樣率的方法,使得采集的樣本更具有代表性。

研究人員分析了28個兒童白血病病例的基因組數據,以驗證其有效性。結果顯示,28個病例中有24例檢測出了重要基因組變異,其中12個病例是以往方法難以檢測出的基因組結構異常。此外,以往測序技術耗時長,從提交樣本到結果返回需要超過一個月時間,而新的基因組分析法72小時就能獲得結果。

公報說,本項研究構建的分析方法應用範圍廣泛,還能用於藥物代謝相關的基因詳細分析,還可檢測出可成爲治療效果指標的基因組變化。不過,與現有測序技術相比,自適應採樣在檢測單核苷酸變異、小片段基因的插入和缺失方面並不具備優勢。研究人員計劃通過完善分析軟件等方法提高成功率。

本項研究相關成果已發表於新一期《血癌雜誌》上。(完)