在高雄轉乘無優惠 悠遊卡公司痛批高雄市府行政干預
針對悠遊卡在高雄遭受不平等待遇一事，悠遊卡公司迴應直指高雄市政府以行政干預，明知修改驗票機設定至少需三個月，事前卻遲遲拒絕同意提供轉乘優惠，「媒體披露的『悠遊卡公司自己不來設定』與事實不符」；悠遊卡公司強調，在高雄市政府對於明年度優惠方案尚未確定的情況下，設備何時進行修改、悠遊卡何時可提供高雄捷運轉乘優惠等，皆須視高雄市政府而定。
104年9月一卡通可單匣門進入北捷前，北、高捷運雙方即設定105年7月悠遊卡與一卡通可在北、高捷運全面互通，悠遊卡當時亦極力爭取悠遊卡轉乘高雄市公車優惠、進入輕軌、渡輪等交通設施事宜，並期待悠遊卡持卡人於105年7月1月起，於搭乘高捷時可同步享有與一卡通相同之優惠。
但遺憾的是，悠遊卡公司爲使持卡人能如期在高捷使用，因此於105年7月1日前已完成高捷驗票機之修改，惟高雄市政府明知驗票機之修改至少需耗時三個月，卻直到悠遊卡完成驗票機設備修改、正式在高捷上線後，才同意給予優惠，同時又通知悠遊卡公司106年高雄市公車優惠方案將有所不同。
悠遊卡公司表示，驗票機修改作業，除須耗時3個月外，且經詢高捷及公車驗票機設備廠商，無論是高捷或是公車驗票機的雙向轉乘功能修改，依其現行排程，最快也要10月才能完成，「公司在高雄市政府同意給予優惠後，立刻進行今年度進行驗票機修改作業，也無法於今年提供民衆轉乘優惠」，且高雄市政府對於明年度優惠方案尚未確定之情況下，設備何時進行修改、悠遊卡何時可提供高雄捷運轉乘優惠等，都要視高雄市政府裁量。
悠遊卡公司認爲，進入高捷的主要考量在於提升對悠遊卡持卡人的服務，然高捷轉乘高市公車的優惠部分，尚待高雄市政府提出新優惠方案出爐後，悠遊卡公司即會按此修改高市公車驗票機，讓悠遊卡持卡人能享受與一卡通持卡人相同的轉乘優惠，在此之前，使用悠遊卡搭乘高雄市公車，不論是否經由高捷轉乘，悠遊卡公司均會自行提供持卡人每趟UUPON點數5點之優惠。