日本科學家新成果:檢測新型SARS-CoV-2變體
熊本大學的研究人員在抗擊 COVID-19 方面取得了重大突破,開發了“Intelli-OVI”,這是一種能夠快速識別 SARS-CoV-2 病毒新變種的尖端診斷工具。
這項工作發表於《通訊醫學》雜誌。
這個新系統將先進的 DNA 檢測技術與計算算法相結合,提供了一種更快、更具成本效益的監測病毒突變的方法,這可能在未來大流行的管理中發揮關鍵作用。
隨着新冠疫情的持續發展,儘管疫苗接種和過去感染產生的羣體免疫導致重症病例相較於早期有所減少,但新的 SARS-CoV-2 病毒變體已然出現,這給公共衛生的監測和應對帶來了重大挑戰。
傳統方法,如全基因組測序(WGS),雖然準確,但耗時且昂貴。Intelli-OVI 提供了一種更快的替代方案,將 IntelliPlex 微盤技術與創新算法——客觀變異體識別(OVI)相結合,能夠高精度地檢測和區分 20 餘種 SARS-CoV-2 變體。
“我們的系統可以輕鬆更新以追蹤新的病毒變異,”熊本大學人類逆轉錄病毒感染聯合研究中心(JRCHRI)的首席研究員佐藤依文教授表示。“這種適應性對於早期檢測新出現的變異株極爲重要,能夠迅速採取行動以防止其進一步傳播。”
IntelliPlex 技術利用印有獨特圖形模式(πCode)的微盤來捕獲和分析病毒的特定基因突變。這使得該系統能夠同時處理多種病毒變異,大大加快了檢測過程。隨後,OVI 算法通過對獨特的突變模式進行分析來解讀數據,識別已知和新的變異株。
在實驗室的測試裡,Intelli-OVI 通過使用 35 種不同的 DNA 探針成功識別出超過 20 種變體,包括奧密克戎變體的幾個亞型。與傳統的基於 PCR 的方法不同,傳統方法只限於檢測少量的突變,Intelli-OVI 理論上一次可以分析多達 100 個病毒突變位點,這使其成爲現有的最爲全面的診斷工具之一。
隨着 Intelli-OVI 的成功開發,熊本大學準備爲全球的大流行防範作出重大貢獻。研究團隊希望這項技術可以應用於其他快速進化的病毒,爲早期的檢測和遏制工作提供重要的工具。
“這種新的診斷工具很有可能徹底改變我們監測病毒突變的方式,”佐藤教授補充道。