天界神加持 有求必應
明朝末年，有漳泉地區的人士，相約到臺灣開墾，出發之前特地到天公廟，稟香擲筊恭請玉皇上帝、王皇三公主娘香火以及玉皇四太子木雕神像乙尊，隨身供奉到臺灣開墾，以祈求一路平安。
到達臺灣之後，就在臺南尖山居住下來，並且將香火及神像供奉在尖山頂上，並且建造一座天壇供奉，也成爲臺灣地區奉祀玉皇大天尊的起源，這也是後來爲何廟號取爲「臺南開基玉皇宮」。
玉皇宮的所在位置，就在臺南府城「鳳凰展翅龍脈」上。「鳳凰展翅龍脈」就是臺南府城的七座小山丘，分佈的形態就像一隻展翅的鳳凰，這七座山丘分別是尖山、赤崁、鷲嶺、侖仔頂、覆鼎金、山仔尾、桂仔山。
開基玉皇宮所供奉神祇幾乎都是天界神，這裡的神明都有許多神蹟故事，想講也講不完。用簡單一點來說，臺灣有許多的宮廟都是在這裡向玉皇大天尊請領玉旨，才設立宮廟濟世（這裡可說是天界的總統府）。
所以有此一說，平民百姓來這裡拜拜幾乎有求必應，但爲非作歹的人，到這裡真心懺悔，也會得到點化。如果爲非作歹的人，不思悔改，反而會受到懲戒。
除了宮廟需要領旨令，通靈的靈乩或乩童，或是代天行事的神職人員、法師，也都需要領旨領令，所以許多通靈人也都會來此向玉皇大天尊請旨。所以這裡除了一般信衆外，還有許多通靈高人進出。
※正月九日玉皇上帝萬壽祝壽大典（初八晚上子時開始）、正月十五日天官大帝聖誕，乞平安龜（又稱居財龜）活動。
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