遭爆曾任共軍色彩機關技術顧問 吳茂昆：從沒去過
行政院16日傍晚召開記者會，宣佈由中硏院院士、東華大學前校長吳茂昆接任教育部長。但吳茂昆接連被國民黨爆料曾任大陸2官方研究機構顧問，晚上又被爆料2004年還曾任中國「西部超導材料科技有限公司」技術顧問，當時他還在任國科會主委。但吳茂昆晚間聲明強調，「這完全是莫須有的指控」，他根本沒去過這間公司。
總統府前副秘書長羅智強晚間再爆料，2004年吳茂昆正擔任國科會主委，擔任中國大陸「西部超導材料科技有限公司」技術顧問。「西部超導」母公司是西北有色金屬研究院，是大陸「軍用」稀有金屬科研生產基地，榮獲大陸「高技術武器裝備發展建設工程突出貢獻獎」、「國防科技創新團隊」等殊榮肯定。
羅智強說，一個部長級的科技高官，在擔任國科會主委的同一年，跑到有中共軍方色彩的機關當技術顧問，這中間難道不需要去查一下有無違法？有無涉及泄密？擔任「技術顧問」，有沒有收取報酬？照民進黨平常扣人賣臺標準，早該拖出去槍斃了。
不過，根據《聯合新聞網》報導，吳茂昆晚間發表聲明指出，「這完全是莫須有的指控」。他2004年還在擔任國科會主委，不可能接任何中國的職務。他指出，他確實知道這間公司，其以前的負責人爲中國的院士。但他從來沒去過這間公司，更沒接受過任何這間公司的職務。